Javier Sánchez realizó su tesis doctoral en el Instituto de Astrofísica de Andalucía en Granada, España sobre dinámica de galaxias y materia oscura. Posteriormente hizo una estancia posdoctoral de dos años en la Universidad de Newcastle upon Tyne, Inglaterra dedicada a estudiar la dinámica del gas en los cúmulos de galaxias. Allí desarrolló un código numérico para hacer simulaciones magnetohidrodinámicas.

Sus principales campos de interés son la dinámica estelar y la hidrodinámica. En particular, esta interesado en la dinámica de las galaxias y estabilidad de los discos galácticos, los alabeos galácticos, los halos de materia oscura y sus alternativas, las partes externas de las galaxias, las galaxias enanas, las inestabilidades del medio interestelar, la formación de nubes y la generación de turbulencia en el medio interestelar, y la interacción de objetos masivos con el medio circundante.

En general, el Dr. Sánchez Salcedo disfruta de buscar maneras para poner a prueba o restringir los modelos astrofísicos.